Indy vs Axonaut : lequel choisir ?

9 min

Mis à jour le 14 octobre 2026

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Indy, idéal pour les indépendants, propose un logiciel gratuit de comptabilité et facturation automatisée. Axonaut centralise la gestion des TPE/PME avec toutes les fonctionnalités ERP incluses. Choisissez celui qui convient à vos besoins spécifiques.

En bref :

  • Indy : Logiciel de comptabilité automatisée pour indépendants, avec compte pro gratuit, facturation illimitée et télétransmission des déclarations fiscales directement aux impôts.
  • Axonaut : ERP tout-en-un français pour TPE/PME qui centralise CRM, facturation, comptabilité, trésorerie, RH, marketing et gestion de projet dans une seule solution.
  • Indy est idéal pour les indépendants, micro-entrepreneurs, EI (BNC), sociétés de services, SCI et LMNP.
  • Axonaut est idéal pour les TPE, PME et indépendants ambitieux avec 2 à 50 salariés.

Vous hésitez entre Indy et Axonaut pour gérer votre facturation et votre comptabilité ? Ces deux outils s’adressent à des profils très différents, et choisir le mauvais peut vous coûter du temps et de l’argent.

Ce comparatif Indy vs Axonaut passe en revue les tarifs, les fonctionnalités et les cas d’usage concrets pour vous aider à faire le bon choix. Sans biais, sans langue de bois.

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Indy en bref

Site internet Indy

Indy est un logiciel de comptabilité automatisée pensé pour les indépendants : micro-entrepreneurs, EI en BNC, sociétés de services, SCI et LMNP. Il propose une offre gratuite qui inclut un compte pro, une carte Mastercard et une facturation illimitée.

La startup revendique plus de 200 000 utilisateurs et a pris le pari audacieux de rendre gratuit son logiciel de comptabilité et de facturation en 2022. Son modèle économique repose sur les offres Premium de déclarations fiscales : Indy veut clairement devenir une alternative à l’expert-comptable.

Points forts :

  • Offre gratuite exceptionnelle : compte pro avec carte Mastercard, facturation illimitée et comptabilité, sans débourser un centime
  • Automatisation comptable poussée avec synchronisation bancaire et catégorisation des transactions par intelligence artificielle
  • Télétransmission des déclarations fiscales (TVA, 2035, liasse fiscale) directement aux impôts depuis l’interface (offre Premium)

Limites :

  • Pas de devis modulables : le client reçoit un document figé, sans possibilité de sélectionner des options selon ses besoins
  • Trop orienté comptabilité : l’outil peut sembler surdimensionné pour un freelance qui cherche avant tout à créer des devis attractifs et à encaisser rapidement
  • Aucun support téléphonique : chat et FAQ uniquement, ce qui peut devenir frustrant en cas de problème urgent

Tarifs : Indy propose une formule gratuite complète (compte pro + facturation + comptabilité). Les offres payantes démarrent à 12€/mois (offre Plus) et montent jusqu’à 59€/mois pour l’offre Premium société.

Axonaut en bref

Site internet Axonaut

Axonaut est un ERP 100% français qui réunit CRM, facturation, comptabilité, gestion RH, marketing et suivi de projet dans une seule plateforme. Il cible principalement les TPE et PME de 2 à 50 salariés qui veulent centraliser tous leurs outils de gestion.

Basé à Toulouse, Axonaut affiche une politique tarifaire atypique : une seule formule qui inclut toutes les fonctionnalités, sans module supplémentaire à payer. L’entreprise n’a jamais augmenté ses prix pour ses clients existants mais cette richesse fonctionnelle se paie : minimum 70€/mois sans engagement.

Points forts :

  • Solution tout-en-un sans surcoût par module : CRM, facturation, comptabilité, RH, marketing et gestion de projet sont inclus dans le même abonnement
  • Service client français reconnu parmi les meilleurs du marché : réactif, personnalisé, disponible par téléphone et par chat
  • Compte pro intégré avec IBAN français et carte Mastercard, sans frais supplémentaires

Limites :

  • Pas de devis modulables : le client reçoit un document classique, sans option de personnalisation des prestations à la volée
  • Tarif élevé pour un solo-entrepreneur (70€/mois sans engagement) : difficile à justifier si vous avez uniquement besoin de facturer
  • Aucune version gratuite ni formule allégée : vous payez l’intégralité des fonctionnalités, même celles que vous n’utiliserez jamais

Tarifs : Pas de formule gratuite, mais un essai de 15 jours sans CB. L’abonnement débute à 28€/mois avec un engagement sur 3 ans, et monte à 69,99€/mois sans engagement, auxquels s’ajoutent 29,99€ par utilisateur supplémentaire.

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Comparatif détaillé : Indy vs Axonaut

Tarifs

Le fossé tarifaire entre les deux outils est significatif. Indy mise sur la gratuité pour conquérir le marché des indépendants, là où Axonaut assume un positionnement premium justifié par l’étendue de ses fonctionnalités.

OffreIndyAxonaut
Formule gratuite✅❌
Entrée de gamme12€/mois (offre Plus)28€/mois (engagement 3 ans)
Haut de gamme59€/mois (offre Premium société)69,99€/mois (sans engagement) + 29,99€/utilisateur supplémentaire

Verdict tarifs : Indy est clairement moins cher, surtout grâce à son offre gratuite qui reste très complète. Axonaut se justifie uniquement si vous avez besoin d’un véritable ERP avec CRM et gestion RH intégrés.

Création de devis

Les deux outils permettent de créer des devis en illimité. Mais dans les deux cas, le devis est un document statique : si le client veut modifier le périmètre, vous devez repartir de zéro.

  • Indy : Devis illimités inclus dès la formule gratuite, format PDF standard envoyé par email.
  • Axonaut : Devis illimités avec personnalisation graphique possible, mais toujours sous forme de document figé côté client.

Facturation et paiement

Sur la facturation pure, les deux outils couvrent l’essentiel. La principale différence se situe sur la signature électronique, absente chez Indy.

  • Factures illimitées : Indy ✅ | Axonaut ✅
  • Signature électronique : Indy ❌ | Axonaut ✅ (en supplément via partenaire)
  • Paiement en ligne : Indy ✅ (Stripe) | Axonaut ✅ (Stripe, GoCardless, PayPal)
  • Relances automatiques : Indy ✅ (offre Premium) | Axonaut ✅

Verdict : Axonaut est légèrement plus complet sur la facturation, notamment grâce à la signature électronique et aux relances disponibles sur toutes les formules. Chez Indy, les relances automatiques sont réservées à l’offre Premium.

Comptabilité et gestion

C’est là qu’Indy brille vraiment. La comptabilité est le cœur du produit, avec une automatisation qui va bien au-delà de ce que propose Axonaut en la matière.

  • Synchronisation bancaire : Indy ✅ | Axonaut ✅
  • Comptabilité intégrée : Indy ✅ | Axonaut ✅

Verdict : Indy va plus loin sur la comptabilité avec la télétransmission des déclarations fiscales et la catégorisation automatique par IA. Axonaut propose une pré-comptabilité solide et un export comptable, mais sans aller jusqu’à la déclaration fiscale automatisée.

Support client

Un point important quand on est indépendant et qu’un bug bloque votre facturation en pleine fin de mois.

  • Indy : Support par chat et FAQ, sans accès téléphonique.
  • Axonaut : Support par chat et par téléphone, avec une réputation de réactivité bien établie.

Verdict : Axonaut prend l’avantage sur le support client grâce au téléphone, un vrai plus pour les structures qui ne peuvent pas se permettre d’attendre une réponse par chat.

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Tableau comparatif complet

Une vue d’ensemble pour comparer Indy et Axonaut en un coup d’œil.

CritèreIndyAxonaut
Formule gratuite✅❌
Devis illimités✅✅
Factures illimitées✅✅
Devis modulables❌❌
Signature électronique❌✅
Paiement en ligne✅✅
Relances automatiques✅✅
Synchronisation bancaire✅✅
Comptabilité intégrée✅✅
Support chat✅✅
Support téléphone❌✅
Tarif d’entrée12€/mois (offre Plus)28€/mois (engagement 3 ans)

Indy ou Axonaut : lequel choisir ?

Choisissez Indy si…

  • Vous êtes indépendant, micro-entrepreneur, en EI (BNC), en SCI ou en LMNP, et vous cherchez un outil gratuit et complet pour démarrer
  • Vous voulez automatiser votre comptabilité sans passer par un expert-comptable : synchronisation bancaire, catégorisation IA et télétransmission fiscale font partie de vos priorités
  • Votre budget est limité et vous avez besoin d’un compte pro avec carte Mastercard sans frais mensuels
  • Vous gérez seul votre activité et n’avez pas besoin d’un CRM, de gestion RH ou de modules marketing

Choisissez Axonaut si…

  • Vous dirigez une TPE ou une PME de 2 à 50 personnes et vous cherchez à centraliser tous vos outils de gestion dans une seule solution
  • Vous avez besoin d’un CRM intégré pour suivre vos prospects, d’une gestion de projet et d’un module RH
  • Le support téléphonique est une priorité pour votre équipe, notamment pour les problèmes urgents
  • Vous êtes prêt à investir dans un ERP complet et vous voulez un outil qui n’augmentera pas ses tarifs pour les clients fidèles

Et si aucun des deux ne vous convient ?

Indy et Axonaut sont de bons outils, mais ils partagent une limite commune : les devis restent des documents figés. Si votre client veut ajuster le périmètre, vous devez créer une nouvelle version et la renvoyer.

Pour les freelances et agences du web qui veulent aller plus loin, il existe une 3ème option : Selki.

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Selki : des devis modulables uniques sur le marché

Selki est le seul logiciel de facturation qui propose des devis avec options cochables par le client. Concrètement :

  1. Vous créez votre devis avec des lignes obligatoires et des options facultatives
  2. Vous envoyez un lien sécurisé à votre client
  3. Le client coche les options qu’il veut
  4. Le prix se recalcule automatiquement
  5. Il valide et signe en ligne

Fini les allers-retours par email. Fini les versions V1, V2, V3. Un seul devis interactif qui s’adapte au choix du client.

Ce que propose Selki :

  • Devis modulables avec options cochables par le client
  • Prix recalculé en temps réel selon les choix
  • Lien sécurisé avec code à 4 chiffres
  • Notification dès que le client consulte le devis
  • Paiement en ligne via Stripe
  • Espace client dédié
  • Formule gratuite disponible

Tarifs : Gratuit, puis 14€/mois (Starter) ou 29€/mois (Pro).

Notre verdict

Indy : Un choix redoutable si votre priorité est d’automatiser votre comptabilité et vos déclarations fiscales sans expert-comptable. Gratuit, complet et très bien noté (4,8/5 sur Trustpilot avec plus de 12 000 avis), c’est l’outil idéal pour les indépendants qui veulent gérer leur comptabilité en autonomie. En revanche, si vous cherchez des devis qui convertissent et une expérience client moderne, Indy reste avant tout un outil comptable.

Axonaut : Un ERP solide pour les PME structurées qui ont besoin de tout centraliser : CRM, facturation, RH, projets dans un seul outil. Le service client téléphonique et la politique tarifaire stable en font une référence dans sa catégorie. Mais pour un freelance ou une agence web qui veut simplement facturer et envoyer des devis percutants, c’est trop lourd et trop cher.

Selki : Le meilleur choix pour les freelances et agences du web qui veulent des devis interactifs et une expérience client différenciante, sans payer pour des fonctionnalités inutiles.

Le choix dépend de vos priorités :

  • Indépendant qui veut automatiser sa comptabilité et ses déclarations fiscales → Indy
  • TPE/PME qui cherche à centraliser CRM, RH et facturation dans un ERP complet → Axonaut
  • Freelance ou agence web qui veut des devis modulables et une expérience client moderne → Selki
Indy se concentre sur l’automatisation comptable pour indépendants, tandis qu’Axonaut est un ERP complet pour TPE/PME. Selki, quant à lui, offre des devis interactifs modulables.
Pour un freelance, Indy gère bien la comptabilité tandis qu’Axonaut est trop complet et coûteux. Selki est une alternative avantageuse grâce à ses devis modulables.
Indy est moins cher avec une offre gratuite complète. Selki propose également une formule gratuite et des devis modulables, offrant ainsi un excellent rapport qualité-prix.

Article mis à jour le 14 octobre 2026

Image de Noëline Dupuped
Noëline Dupuped
Rédactrice spécialisée dans les sujets liés à la facturation, à la gestion et aux outils pour indépendants. Elle aide les freelances et entrepreneurs à mieux gérer leur activité avec Selki.

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